赵文华将浙直两省的精锐要回来后，当即就交给了胡宗宪和唐顺之，赵文华很清楚，自己又不会打仗，唐顺之、胡宗宪都是知兵之人，肯定比他赵文华的水平高，放手给他们指挥，赵文华这点自知之明还是有的，还有个考虑就是到时候方便推卸责任。
赵文华在安排兵力的时候，张经也在调集兵力，准备与倭寇大战一场，虽然现在张经不再是总督了，但是他还是南京兵部尚书参赞机务，可以调动南京的部分驻军。张经将操江提督下的水师悉数调来，驻泊于苏松和嘉兴附近的港口。
作为新任浙直总督，赵文华在上任后的第一件事就是筹措军费，和张经准备与倭寇大战不同，赵文华的主张是先修缮各处的城墙，防止倭寇袭扰大明的州县，减少倭寇带来的损失，所以赵文华决定在浙直沿海的州县修葺城墙，加强防备。
赵文华已经和唐顺之、胡宗宪等人商量好了，军费和修筑城墙的一共是一百三十万两，其中浙江军费四十七万两，江南五十万两，江北一十七万两，地方州县和总督各分摊一半，赵文华已经算过了，浙直等处可以加派提编一共是四十三万两，，还缺少二十万两。
这二十万两，其中十万两由两淮食盐工本银中拨出，另外十万两，赵文华也已经有的着落，就是南京兵部积贮船料银，这笔银子差不多有十万两，足够前线军需。
不过赵文华知道，现在是张经当这个南京兵部尚书，想从张经手里要这十万两肯定是不现实的，唯一的办法就是通过京师，赵文华只得向朝廷上疏索要这笔银子。
赵文华给朝廷上了一道奏疏名为请拨南京兵部结余以纾民困疏的奏疏。