而吏科都给事中虽然有监督吏部的权力，吏科是吏部的对口衙门，因此在京察中难免出现科部意见存异之情形。由于吏部尚书位高权重，而吏科之长仅为七品官员，故对于人员之去留，通常科臣仅享有话语上的建议权，而吏部尚书则享有最终裁决权。
科部之争一向是京察中的一个很激烈的矛盾，这次殷正茂的上疏，无疑触动了李默的神经，李默早就视这次京察为自己大展拳脚的好机会，故而视有关本次京察的一切事物为禁脔，殷正茂的上疏，无疑使得李默大为光火。
而且殷正茂还是嘉靖二十六年进士，是徐阶的门生，这就更令李默不满了，因为文选司郎中陆光祖就是徐党的骨干，而陆光祖在吏部经常贯彻徐阶的意图，给李默这个吏部尚书软钉子吃，搞得李默对他极为不满，只是由于徐阶的支持再加上李默现在主要是跟严嵩过不去，所以对徐阶极其党羽采取了忍让的措施。
但是这次殷正茂的上疏无疑是激怒了李默，在吏部还没有准备好京察的一系列事情时，殷正茂就率先上疏，肯定是受到了徐阶的指使，李默决定反击徐阶，李默当即弹劾殷正茂妄言大事，不尊体例，请求嘉靖将殷正茂逐出科道。
吏部尚书和吏科都给事中发生冲突还真是一件十分少见的事情，因为吏科本就是监察吏部的，吏部尚书（本章未完，请翻页）
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